CpG岛分析工具用于分析CpG岛的潜在区域,分析算法请参考文献Gardiner-Garden and Frommer (1987)。算法采用大小为200bp、步长为1的滑动窗口进行计算。CpG岛是Obs/Exp值大于60%,GC含量大于50%的一段序列。期望值(Exp)=‘C’的出现次数 * ‘G’的出现次数 / 滑动窗口大小。CpG岛一般出现在脊椎动物基因的5'端,所以此工具可以在基因组中标记出潜在基因。
CpG岛分析工具用于分析CpG岛的潜在区域,分析算法请参考文献Gardiner-Garden and Frommer (1987)。算法采用大小为200bp、步长为1的滑动窗口进行计算。CpG岛是Obs/Exp值大于60%,GC含量大于50%的一段序列。期望值(Exp)=‘C’的出现次数 * ‘G’的出现次数 / 滑动窗口大小。CpG岛一般出现在脊椎动物基因的5'端,所以此工具可以在基因组中标记出潜在基因。