一、概述
亲和力是判定分子间相互作用的重要参数,是了解分子以及药物的发现与筛选等的重要指标。对于药效的评价、生物大分子及其复合体的稳定性的评估需要从动力学、热力学和热稳定性等方面进行:包括分子间的结合、结合的快慢、结合的强弱、结合的机理等多方面的全面性研究。
普健生物提供的表面等离子共振(Surface Plasmon Resonance, SPR)服务能够实现对蛋白,抗体、多肽、核酸及小分子化合物等相互作用的定性定量分析,也可以对细胞裂解液、文库样本等依托LSPR-Selex技术垂钓筛选未知靶标。
SPR芯片工作原理示意图
二、服务内容
服务内容 | 交付内容 |
服务周期 |
样本准备(可选) | 蛋白/抗体/多肽/核酸/小分子等 | / |
亲和力测定 | 亲和力检测报告;结合常数(Ka)、解离常数(Kd)、亲和常数(KD);响应曲线;亲和力强弱排序 | 2-3周 |
三、实验流程
1、按照 OpenSPRTM 仪器标准操作程序安装 NTA 芯片。
2、开始以最大流速(150 µL/min)运行,检测缓冲液PBS(pH7.4)。
3、达到信号基线后,调整缓冲液的流速到20 µL/min。
4、开始激活芯片,取出制备好的咪唑和NiCl2 溶液,通过进样口注入,与传感器相互作用5min完成芯片表面功能化,准备配体。
5、用激活缓冲液稀释用于固定的配体, 体积为200µL浓度为10-50µg/mL ,通过进样口注入相互作用4 min。
6、观察基线5 min,以确保稳定。
7、通过比较注入配体前后的信号测量配体结合的量。如果需要更多的配体,可以再次注入配体。
8、配体信号稳定之后,开始注入高浓度的分析物,以确认配体的活性,并确认表面大致的最大结合能力。
9、将流速提高到150 µL/min,注入适当的再生缓冲液,以去除分析物。
10、分析物用缓冲液稀释,浓度详见实验结果,并以20 µL/min 上样,蛋白与配体结合时间均为240 s;自然解离420 s。
11、本次实验结果所使用分析软件为:TraceDrawer (Ridgeview Instruments ab, Sweden),分析方法是 One To One 分析模型。
四、结果分析
动力学及亲和力参数
参数 |
释义 | 结果 |
ka (1/(M*s)) | 结合速率常数 | 2.82e5 |
kd (1/s) | 解离速率常数 | 4.16e-4 |
KD (M) | 解离平衡常数,也叫亲和力常数 | 1.48e-9 |
结果说明:靶蛋白跟 Gidn 的亲和力为48 nM.
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