抗体测序,其实就是对抗体蛋白进行从头到尾的一次序列测试工作,它广泛应用于基因组序列、外显子序列、DNA甲基化序列以及RNA转录组序列。在我们进行单克隆抗体生产的时候,就常常会使用抗体测序技术,可以说,杂交瘤技术是目前抗体测序技术会用最广泛且最成熟的一个平台。
什么是抗体测序技术?
其实抗体测序技术的原理和我们上面说的一样,就是通过对抗体蛋白进行从头到尾的测序。通过多酶解技术,通过高分辨率质谱和独特的数据分析的方式来进行相关序列的检测。其原理为通过测量串联质谱中两个片段离子之间的质量差来确定蛋白氨基酸残基的质量,然后沿着蛋白的主链来确定每个氨基酸,最终得到氨基酸的完整序列的方式。
抗体测序的主要流程是什么?
1、全序列覆盖
在通过如上方法进行抗体测序的时候,需要确保每个点位的氨基酸有超过10中不同的肽段支持,在对氨基酸进行质量控制,确保每个质谱里都有强离子片段峰证据。这样,才能保证其全序列覆盖;
2、抗体质量核对
对轻重链进行质量测定,确保其在范围内,以确保组装的抗体序列;
3、亮氨酸和异亮氨基酸确定
亮氨酸和异亮氨酸的残基通常是无法区分的,但是却又容易造成其亲和力出现偏差的情况。所以,我们在进行相关测试的时候,可以使用一种集成的策略,通过同源性数据统计的方式,明确区分亮氨酸和异亮氨酸;
其实抗体测序的原理并不复杂,但是,很多用户在自行进行相关测序的时候,往往会出现这样或那样的问题,最终造成结果偏差的情况。总的来说,主要是一些细节方面的问题,只要将这些方面的做好,测序则完全不是问题。普健生物专业为广大用户提供抗体制备、蛋白表达以及抗体测序服务,如果您有相关需求,欢迎来电咨询。